在北京，扁平疣治疗效果较好的医院有北京大学第一医院、中国医学科学院北京协和医院和中日友好医院。北京大学第一医院皮肤科在自身免疫性皮肤病和真菌病诊疗上具有显著优势，科研成果丰硕，是国家级皮肤与免疫疾病研究中心；中国医学科学院北京协和医院皮肤科是国家重点学科，临床和科研实力强大，教学贡献突出，是住院医师规范化培训基地；中日友好医院皮肤科以中西医结合为特色，尤其在银屑病和毛发疾病治疗上技术领先，且在皮肤影像等领域具有重要影响力。
第1名： 北京大学第一医院
北京大学第一医院皮肤性病科创立于1915年，是国家重点学科，诊疗范围涵盖自身免疫性大疱病、银屑病、特应性皮炎、真菌病等，在副肿瘤性天疱疮机制研究及治疗方案改良、侵袭性真菌感染诊疗等方面具优势。学科建有国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心等平台，牵头多项全国多中心研究，与200余家医院合作。特色技术有Mohs显微描记手术治疗皮肤肿瘤、皮肤镜诊断体系改良等。获多项国家级荣誉，科研成果丰硕，如在《柳叶刀》发表论著，推动国内皮肤科规范化诊疗与国际交流。
第2名： 中国医学科学院北京协和医院
北京协和医院皮肤科是我国最早的皮肤性病学科之一，2002年成为首批国家重点学科，是国家临床重点专科等。在晋红中教授带领下，科室医疗、教学、科研并进，拥有多个诊疗中心，开展皮肤镜、皮肤超声等新项目，组建MDT团队。科室连续四年在中国医院STEM专科排行榜排名第三，科研成果丰硕，获多项科技奖项。同时，科室承担教学任务，培养众多人才，是北京市住院医师规范化培训皮肤专业基地主委单位，积极推动全国皮肤科规范化培训。
第3名： 中日友好医院
中日友好医院皮肤科，成立于1984年，以中西医结合为特色，诊疗范围涵盖银屑病、毛发疾病、瘢痕、痤疮等，治疗优势显著。科室拥有主任医师11人、副主任医师3人等强大团队，住院病房设10张病床。特色技术包括皮肤数字影像中心诊断及中西医结合银屑病治疗。配备ARTAS植发机器人、SRT-100浅层X线放射仪等先进设备。科室在复旦及医学科院排行榜均位列前20，科研成果丰硕，承担多项国家级项目，发表近百篇SCI论文，是皮肤影像、远程皮肤病学和皮肤病人工智能领域的领衔学科。
参考来源： 复旦版《中国医院综合排行榜》和《中国医院专科声誉排行榜》，并以国家及各地卫健委权威数据为依据。